Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9D1F3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D1F3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms