Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms