Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms