Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms