Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Exosc7Q9D0M0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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