Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rfc5Q9D0F6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rfc5Q9D0F6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rfc5Q9D0F6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rfc5Q9D0F6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfc5Q9D0F6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfc5Q9D0F6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfc5Q9D0F6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc5Q9D0F6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms