Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mdm1Q9D067 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mdm1Q9D067 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms