Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acsl3Q9CZW4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acsl3Q9CZW4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms