Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp11Q9CZJ1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Utp11Q9CZJ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms