Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms