Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nde1Q9CZA6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms