Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Mrpl55Q9CZ83 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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