Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prdm5Q9CXE0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prdm5Q9CXE0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms