Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms