Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dis3Q9CSH3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dis3Q9CSH3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms