Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PompQ9CQT5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms