Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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