Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd1Q9CQA6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd1Q9CQA6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chchd1Q9CQA6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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