Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trappc5Q9CQA1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc5Q9CQA1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc5Q9CQA1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc5Q9CQA1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc5Q9CQA1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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