Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQ90 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms