Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms