Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CPS8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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