Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim26Q99PN3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms