Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim8Q99PJ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms