Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cdh23Q99PF4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh23Q99PF4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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