Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms