Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms