Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms