Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms