Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PccbQ99MN9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PccbQ99MN9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms