Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
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PtprtQ99M80 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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PtprtQ99M80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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PtprtQ99M80 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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PtprtQ99M80 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprtQ99M80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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