Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lysmd3Q99LE3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms