Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gps1Q99LD4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms