Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pagr1aQ99L02 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms