Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q99KU6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q99KU6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q99KU6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q99KU6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms