Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms