Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab28Q99KL7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab28Q99KL7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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