Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdcbp2Q99JZ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdcbp2Q99JZ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms