Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psip1Q99JF8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psip1Q99JF8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms