Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Pacsin3Q99JB8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pacsin3Q99JB8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pacsin3Q99JB8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pacsin3Q99JB8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pacsin3Q99JB8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pacsin3Q99JB8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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