Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ddb2Q99J79 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ddb2Q99J79 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ddb2Q99J79 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ddb2Q99J79 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddb2Q99J79 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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