Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apobec3Q99J72 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms