Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cldn16Q925N4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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