Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SptssbQ925E8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms