Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrif1Q923B3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms