Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clip1Q922J3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip1Q922J3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms