Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcaf2Q921K8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcaf2Q921K8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms