Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms