Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usb1Q91W78 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms