Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csde1Q91W50 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms